Εκτύπωση αυτής της σελίδας

Εφαρμογή φασματομετρίας μάζας “POTAMOS”

Η εφαρμογή φασματομετρίας μάζας “POTAMOS” είναι ένα εύχρηστο διαδικτυακό εργαλείο που αναπτύχθηκε στο περιβάλλον ανοιχτού λογισμικού “Ruby on Rails”.  Σχεδιάστηκε να προσφέρει υπολογιστικά δεδομένα φασματομετρίας μάζας για να βοηθήσει τον πειραματικό βιοχημικό/βιολόγο που εργάζεται στο πεδίο των μετα-μεταφραστικών τροποποιήσεων των ιστονών. Η εφαρμογή, για την ώρα, εστιάζεται στις ιστόνες. Οι κύριες υπολογιστικές δυνατότητες του προγράμματος που προσφέρονται στον πειραματικό βιοχημικό/βιολόγο είναι: 1. Υπολογισμός των μαζών είτε μιας ατροποποίητης αλληλουχίας αμινοξέων είτε μιας αλληλουχίας αμινοξέων που εν δυνάμει φέρουν μεθυλιώσεις σε αργινίνες και λυσίνες, ακετυλιώσεις σε λυσίνες και φωσφορυλιώσεις σε σερίνες και θρεονίνες. 2. Υπολογισμός των μαζών και των φορτίων ενός φράγματος  μιας ποικιλόμορφης ιστόνης που φέρει μία ή περισσότερες προ-ορισμένες τροποποιήσεις σαν αυτές που αναφέρθηκαν πιο πάνω. 3. Υπολογισμός των μαζών των πεπτιδικών φραγμάτων που παράγονται μετά από την δράση μιας πρωτεάσης σε μία ιστόνη.

Χρησιμοποιήστε την εφαρμογή

© Copyright 2017 | FOUNDATION FOR RESEARCH & TECHNOLOGY - HELLAS | All rights reserved.