Εκτύπωση αυτής της σελίδας
Ιωσήφ Παπαματθαιάκης

Ιωσήφ Παπαματθαιάκης

Ερευνητής IMBB (Καθηγητής, Πανεπιστήμιο Κρήτης)
Ηλ. Ταχυδρομείο
Αυτή η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου προστατεύεται από τους αυτοματισμούς αποστολέων ανεπιθύμητων μηνυμάτων. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε τη JavaScript για να μπορέσετε να τη δείτε.
Τηλέφωνο
+30-2810-391165
Fax
+30-2810-391101
Ιστοσελίδα Εργαστηρίου

Η ομάδα μελετά βασικούς μηχανισμούς  γονιδιακής ρύθμισης.  H κατανόηση των μηχανισμών αυτών  προάγει μακροπρόθεσμα την  ανάπτυξη  νέων χρησίμων  βιοιατρικών εργαλείων και υπηρεσιών.
1.Mελέτη της σηματοεξαρτώμενης  γονιδιακής έκφρασης.Ένα μοντέλο στο οποίο εστιασθήκαμε  τα τελευταία  χρόνια είναι η μεταγραφική ρύθμιση των γονιδίων ιστοσυμβατότητας τάξης ΙΙ (MHC II) τα προϊόντα των οποίων είναι απαραίτητα συστατικά  στη αντιγονοπαρουσίαση.   Έχουμε σημαντική συμβολή στη κατανόηση των ιδιοτήτων της πρωτεΐνης CIITΑ  που είναι ο κύριος ρυθμιστής της έκφρασης των γονιδίων αυτών,  του μηχανισμού ενεργοποιήσης της μεταγραφής μέσω πολλαπλών αλληλεπιδράσεων με άλλους συνενεργοποιητές τύπου ακετυλτρανσφεράσης, τη PolI κινάση,  τη εδραίωση του ενισχυοσώματος στο υποκινητή, την κυτταροπλασματική-πυρηνική   διακίνηση της πρωτεΐνης και άλλες πρωτεινικές αλληλεπιδράσεις. Δείξαμε ότι επιγενετική τροποίηση πχ αναστολή απεκατυλίωσης σε Β λεμφοειδή κύτταρα  μπορεί να υποκαταστήσει τη παρουσία του CIITA και να ενεργοποιήσει τη μεταγραφή τόσο των γονιδίων ΜΗCII  όσο και πολλών άλλων γονίδιων, μεταξύ των οποίων α/β-Ιντερφερόνης  και πολλών γονιδίων - στόχων της. Τα αποτελέσματα αυτά είναι σημαντικά τόσο  στη κατανόηση του τρόπου του φυσιολογικού αλλά και του φαρμακολογικού τρόπου   ενεργοποίησης των γονίδιων MHCΙΙ και ενίσχυσης της ανοσοαπάντησης.  
2. Επιγενετική μνήμη και γονιδιακή σήμανση.  Η διατήρηση έκφρασης  ή και η απενεργοποίηση γονιδίων δια μέσου του κυτταρικού κύκλου- ειδικά κατά τη μίτωση που καταρρέει ο μεταγραφικός μηχανισμός- θέτουν ένα σημαντικό πρόβλημα   φαινοτυπικής σταθερότητας στα απόγονα κύτταρα.  Μελετώντας  το τρόπο γονιδιακής σήμανσης   (αν και πως τα γονίδια σημαίνοντα ώστε μετά  την μίτωση  να διατηρήσουν το ίδιο πρότυπο έκφρασης)  χαρακτηρίσαμε νέους μηχανισμούς επιγενετικής σήμανσης και μνήμης που σχετίζονται με τον έλεγχο της γονιδιακής έκφρασης: Α. μεσοπρόθεσμη  επιγενετική μνήμη που εξασφαλίζει η  γειτνίαση του σωματίου PML (Promyelocytic Leukemia) με το γενετικό τόπo  MHCII και υψηλά επίπεδα μεθυλίωσης Ιστονών  που οδηγούν σε αυξημένη  γονιδιακή ενεργοποίηση σε επόμενη σηματοδότηση. Β. Μιτωτική σήμανση του γονιδίου μέσω της διατήρησης  πρωτεινικών παραγόντων  στον ενισχυτή που ελκύουν φωσφατάση με αντι-συμπυκνωτική δράση για την χρωματίνη.
3. Καρκινικά βλαστοκύτταρα,  PML και microRNA. Αναπτύσσουμε και μελετάμε  νεοπλασματικά μοντέλα  κυττάρων και διαγονιδιακών ποντικών (ΜΜΤV neu, PML KO, SATB1KO) για  τη  διερεύνηση του μηχανισμού δράσης  του PML στον κυτταρικό πολλαπλασιασμό, βλαστικότητα των καρκινικών κυττάρων,  ρόλο στη συντήρηση των τελομερών σε συνδυασμό με γονιδιωματικές τεχνολογίες (Chip seq, RNA  και microRNA seq), ανάλυση FISH και τρισδιάστατες κυτταροκαλλιέργειες. Σε συνεργασία  με ομάδες του Παν. Νοσοκομείου – Ιατρικής του Παν. Κρήτης αναπτύσσουμε τεχνολογίες χαρακτηρισμού/εφαρμογών  στα   κυκλοφορούντα  καρκινικά κύτταρα  και στον επαγόμενο  γενετικό επαναπρογραμματισμό  νεοπλασματικών και φυσιολογικών κυττάρων.

Gialitakis M., P. Arampatzi, T. Makatounakis and J. Papamatheakis (2010) Gamma Interferon dependent transcriptional memory via relocalization of a gene locus to PML nuclear bodies. Mol. Cell. Biol. 30: 2046- 2056.

Garofalakis A, Zacharakis G, Meyer H, Economou EN, Mamalaki C, Papamatheakis J, Kioussis D, Ntziachristos V, Ripoll J. (2007) Three-dimensional in vivo imaging of green fluorescent protein-expressing T cells in mice, with noncontact fluorescence molecular tomography. Mol. Imaging. 6: 96-107.

Gialitakis M, Androniki Kretsovali, Charalampos Spilianakis, Lara Kravariti, Jorg Mages, Reinhard
Hoffmann, Antonis K. Hatzopoulos and Joseph Papamatheakis (2006) Coordinated changes of histone modifications and HDAC mobilization regulate the induction of MHC class II genes by Trichostatin A. Nucleic Acids Research. 34: 765-772.

Muhlethaler-Mottet A, Krawczyk M, Masternak K, Spilianakis C, Kretsovali A, Papamatheakis J, Reith W. (2004) The S Box of Major Histocompatibility Complex Class II Promoters Is a Key Determinant for Recruitment of the Transcriptional Co-activator CIITA. J Biol Chem. 279: 40529-35.

Spilianakis C, Theodora Agalioti, Androniki Kretsovali, Takis Makatounakis Dimitris Thanos, Joseph Papamatheakis (2003) Interferon γ-induced transcription through CIITA-regulated cofactor recruitment and phosphorylation of RNAPII. EMBO J. 19: 5125-5136.

1: Hadjimichael C, Chanoumidou K, Nikolaou C, Klonizakis A, Theodosi GI, Makatounakis T, Papamatheakis J, Kretsovali A. 
Promyelocytic Leukemia Protein Is an Essential Regulator of Stem Cell Pluripotency and Somatic Cell Reprogramming.
Stem Cell Reports. 2017 May 9;8(5):1366-1378.
PMID: 28392218  [PubMed - indexed for MEDLINE]

2: Sachini N, Papamatheakis J.  
NF-Y and the immune response: Dissecting the complex regulation of MHC genes. 
Biochim Biophys Acta. 2017 May;1860(5):537-542.
PMID: 27989934  [PubMed - indexed for MEDLINE]

3: Favicchio R, Psycharakis S, Schönig K, Bartsch D, Mamalaki C, Papamatheakis J, Ripoll J, Zacharakis G.   
Quantitative performance characterization of three-dimensional noncontact fluorescence molecular tomography. 
J Biomed Opt. 21(2):26009, Feb 2016, doi: 10.1117/1.JBO.21.2.026009.
PMID: 26891600  [PubMed - indexed for MEDLINE]

4: Hadjimichael C, Nikolaou C, Papamatheakis J, Kretsovali A.    
MicroRNAs for Fine-Tuning of Mouse Embryonic Stem Cell Fate Decision through Regulation of TGF-β Signaling.  
Stem Cell Reports. 2016 Mar 8;6(3):292-301.
PMID: 26876669  [PubMed - indexed for MEDLINE]

5: Hadjimichael C, Chanoumidou K, Papadopoulou N, Arampatzi P, Papamatheakis J, Kretsovali A.     
Common stemness regulators of embryonic and cancer stem cells.   
World J Stem Cells. 2015 Oct 26;7(9):1150-84.
PMID: 26516408  [PubMed - indexed for MEDLINE]

6: Hadjimichael C, Chanoumidou K, Papadopoulou N, Arampatzi P, Papamatheakis J, Kretsovali A.     
Promyelocytic Leukemia Protein Is an Essential Regulator of Stem Cell Pluripotency and Somatic Cell Reprogramming.   
Stem Cell Reports. 2017 May 9;8(5):1366-1378.
PMID: 28392218  [PubMed - indexed for MEDLINE]

7: Sachini N, Papamatheakis J.      
NF-Y and the immune response: Dissecting the complex regulation of MHC genes.   
Biochim Biophys Acta. 2017 May;1860(5):537-542.
PMID: 27989934  [PubMed - indexed for MEDLINE]

8: Favicchio R, Psycharakis S, Schönig K, Bartsch D, Mamalaki C, Papamatheakis J, Ripoll J, Zacharakis G.       
Quantitative performance characterization of three-dimensional noncontact fluorescence molecular tomography.   
J Biomed Opt. 2016 Feb;21(2):26009.
PMID: 26891600  [PubMed - indexed for MEDLINE]

9: Hadjimichael C, Nikolaou C, Papamatheakis J, Kretsovali A.        
MicroRNAs for Fine-Tuning of Mouse Embryonic Stem Cell Fate Decision through Regulation of TGF-β Signaling.   
Stem Cell Reports. 2016 Mar 8;6(3):292-301.
PMID: 26876669  [PubMed - indexed for MEDLINE]

10: Hadjimichael C, Chanoumidou K, Papadopoulou N, Arampatzi P, Papamatheakis J, Kretsovali A.         
Common stemness regulators of embryonic and cancer stem cells.    
World J Stem Cells. 2015 Oct 26;7(9):1150-84.
PMID: 26516408  [PubMed - indexed for MEDLINE]

11: Stavride P, Arampatzi P, Papamatheakis J.         
Differential regulation of MHCII genes by PRMT6, via an AT-hook motif of RFX5.    
Mol Immunol. 2013 Dec;56(4):390-8.
PMID: 23911394 [PubMed - indexed for MEDLINE]

12: Papadimitriou L, Zerva I, Georgouli M, Makatounakis T, Papamatheakis J, Athanassakis I.         
DOα⁻β⁺ expression in favor of HLA-DR engagement in exosomes.   
Immunobiology. 2013 Aug;218(8):1019-25.
PMID: 23462321 [PubMed - indexed for MEDLINE]

13: Arampatzi P, Gialitakis M, Makatounakis T, Papamatheakis J.          
Gene-specific factors determine mitotic expression and bookmarking via alternate regulatory elements.    
Nucleic Acids Res. 2013 Feb 1;41(4):2202-15.
PMID: 23303784 [PubMed - indexed for MEDLINE]

14: Karantzali E, Lekakis V, Ioannou M, Hadjimichael C, Papamatheakis J, Kretsovali A.           
Sall1 Regulates Embryonic Stem Cell Differentiation in Association with Nanog.   
J Biol Chem. 2011 Jan 14;286(2):1037-45.
PMID: 21062744 [PubMed - indexed for MEDLINE]

15: Gialitakis M, Arampatzi P, Makatounakis T, Papamatheakis J.           
Gamma Interferon-Dependent Transcriptional Memory via Relocalization of a Gene Locus to PML Nuclear Bodies.   
Mol Cell Biol. 2010 Apr;30(8):2046-56.
PMID: 20123968 [PubMed - indexed for MEDLINE]

16: Garofalakis A, Zacharakis G, Meyer H, Economou EN, Mamalaki C, Papamatheakis J, Kioussis D, Ntziachristos V, Ripoll J.           
Three-dimensional in vivo imaging of green fluorescent protein-expressing T cells in mice with noncontact fluorescence molecular tomography.  
Mol Imaging. 2007 Mar-Apr;6(2):96-107.
PMID: 17445504 [PubMed - indexed for MEDLINE]

17: Gialitakis M, Kretsovali A, Spilianakis C, Kravariti L, Mages J, Hoffmann R, Hatzopoulos AK, Papamatheakis J.           
Coordinated changes of histone modifications and HDAC mobilization regulate the induction of MHC class II genes by Trichostatin A. 
Nucleic Acids Res. 2006 Feb 1;34(3):765-72.
PMID: 16452299 [PubMed - indexed for MEDLINE]

18: Muhlethaler-Mottet A, Krawczyk M, Masternak K, Spilianakis C, Kretsovali A, Papamatheakis J, Reith W.           
The S Box Of Major Histocompatibility Complex Class Ii Promoters Is A Key Determinant For Recruitment Of The Transcriptional Co-Activator Ciita.  
J Biol Chem. 2004 Sep 24;279(39):40529-35. 
PMID: 15271997 [PubMed - indexed for MEDLINE]

19: Biel M, Kretsovali A, Karatzali E, Papamatheakis J, Giannis A.
Design, synthesis, and biological evaluation of a small-molecule inhibitor of the histone acetyltransferase Gcn5.
Angew Chem Int Ed Engl. 2004 Jul 26;43(30):3974-6. No abstract available.
PMID: 15274229 [PubMed - indexed for MEDLINE]

20: Muhlethaler-Mottet A, Krawczyk M, Masternak K, Spilianakis C, Kretsovali A, Papamatheakis J, Reith W.
The S box of major histocompatibility complex class II promoters is a key determinant for recruitment of the transcriptional co-activator CIITA.
J Biol Chem. 2004 Sep 24;279(39):40529-35. Epub 2004 Jul 22.
PMID: 15271997 [PubMed - indexed for MEDLINE]

21: Spilianakis C, Kretsovali A, Agalioti T, Makatounakis T, Thanos D, Papamatheakis J.
CIITA regulates transcription onset viaSer5-phosphorylation of RNA Pol II.
EMBO J. 2003 Oct 1;22(19):5125-36.
PMID: 14517250 [PubMed - indexed for MEDLINE]

22: Tzortzakaki E, Spilianakis C, Zika E, Kretsovali A, Papamatheakis J.
Steroid receptor coactivator 1 links the steroid and interferon gamma response pathways.
Mol Endocrinol. 2003 Dec;17(12):2509-18. Epub 2003 Aug 21.
PMID: 12933903 [PubMed - indexed for MEDLINE]

23: Karetsou Z, Kretsovali A, Murphy C, Tsolas O, Papamarcaki T.
Prothymosin alpha interacts with the CREB-binding protein and potentiates transcription.
EMBO Rep. 2002 Apr;3(4):361-6. Epub 2002 Mar 15.
PMID: 11897665 [PubMed - indexed for MEDLINE]

24: Kretsovali A, Spilianakis C, Dimakopoulos A, Makatounakis T, Papamatheakis J.
Self-association of class II transactivator correlates with its intracellular localization and transactivation.
J Biol Chem. 2001 Aug 24;276(34):32191-7. Epub 2001 Jun 18.
PMID: 11413136 [PubMed - indexed for MEDLINE]

25: Das S, Lin JH, Papamatheakis J, Sykulev Y, Tsichlis PN.
Differential splicing generates Tvl-1/RFXANK isoforms with different functions.
J Biol Chem. 2002 Nov 22;277(47):45172-80. Epub 2002 Sep 4.
PMID: 12215433 [PubMed - indexed for MEDLINE]

26: Denaxa M, Pavlou O, Tsiotra P, Papadopoulos GC, Liapaki K, Theodorakis K, Papadaki C, Karagogeos D, Papamatheakis J.
The upstream regulatory region of the gene for the human homologue of the adhesion molecule TAG-1 contains elements driving neural specific expression in vivo.
Brain Res Mol Brain Res. 2003 Oct 21;118(1-2):91-101.
PMID: 14559358 [PubMed - indexed for MEDLINE]

27: Spilianakis C, Papamatheakis J, Kretsovali A.
Acetylation by PCAF enhances CIITA nuclear accumulation and transactivation of major histocompatibility complex class II genes.
Mol Cell Biol. 2000 Nov;20(22):8489-98.
PMID: 11046145 [PubMed - indexed for MEDLINE]

© Copyright 2017 | FOUNDATION FOR RESEARCH & TECHNOLOGY - HELLAS | All rights reserved.